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智能手機獲得新技能,變身顯微鏡掃描DNA

關鍵字:智能手機顯微鏡  醫(yī)療診斷  掃描DNA  電子實驗室模塊

加州大學洛杉磯分校(UCLA)研究人員們最近開發(fā)出一種新的手機附件設備,能將任何智能手機變成一款DNA掃描熒光顯微鏡。這項創(chuàng)新可望對于醫(yī)療診斷帶來深遠影響,并再次展現如何有效利用智能手機來降低醫(yī)療成本,以及為開發(fā)中國家?guī)硐冗M的醫(yī)療診斷技術。

 

這款智能手機的附件包括一個外部透鏡、薄膜干涉濾光器、可微調的微型楔形榫頭支架,以及雷射二極管,全部封裝在一個以3D打印的小型方盒中,并整合成一款手持式熒光顯微鏡。

 

“DNA單分子在拉長時的寬度約2nm,”UCLA霍華德.休斯醫(yī)學院(HHMI)教授Aydogan Ozcan表示,“以透視來看,它使DNA較人的發(fā)絲還細約50,000倍。目前,為單個DNA分子進行成像需要昂貴又龐大的光學顯微鏡工具,使其幾乎僅限于先進的實驗室設置才能進行。相形之下,這款適用于個人手機的附件設備顯然就沒那么昂貴了。”

 

雖然其他“智能手機變身顯微鏡”的設備也能夠成像出較大規(guī)模的對象,例如細胞;但是,Ozcan的研究團隊最新開發(fā)出的這款智能手機光學附件,則是首款可成像DNA單分子纖薄鏈以及調整其大小的設備。

 

該設備主要用于遠程的實驗室設置,以診斷不同類型的癌癥與神經系統(tǒng)疾病,例如阿爾茲海默癥(Alzheimer),以及偵測傳染病的抗藥性。為了利用手機上的相機,首先必須以熒光標記隔絕以及標示所需的DNA。Ozcan表示,如今,這種實驗室程序已經能在偏遠地區(qū)以及資源有限的環(huán)境下進行了。

 

為了掃描DNA,研究團隊開發(fā)出可執(zhí)行在同一支智能手機上的運算接口,以及一款Windows智能應用程序。掃描后的信息可被傳送至遠程Ozcan實驗室中的服務器,然后測量DNA分子長度。在聯機可靠可情況下,完整的數據處理過程只需要10秒鐘的時間。

 

 

《國際電子商情》圖中顯示智能手機安裝該成像設備與用戶接口,并以25美分硬幣作為對比。(來源:UCLA)
圖中顯示智能手機安裝該成像設備與用戶接口,并以25美分硬幣作為對比。(來源:UCLA)
 

 

在Ozcan的實驗室中,研究人員們成像熒光標記與拉伸DNA節(jié)段,為該設備的準確度進行測試。結果發(fā)現它能夠可靠地倍增10,000個堿基對或更長的DNA節(jié)段(堿基對是構成DNA的基本結構單元)。許多重要的基因都落在這個大小范圍,包括為金黃色葡萄球菌與其他細菌提供抗生素抗藥性的細菌基因 ,大約有14,000個堿基對長。

 

然而,由于較短節(jié)段時的訊噪比(SNR)偵測減少以及明顯差異,智能手機顯微鏡在5,000或更短堿基對節(jié)段時的準確度急速下降。這時,必須將該設備的現有透鏡置換成更高數倍數,就可以輕易地解決這個問題。

 

除了用于定點照護診斷,Ozcan建議該平臺也可用于區(qū)別高分子量的DNA節(jié)段,從而有助于解決使用傳統(tǒng)凝膠電泳的問題——在生物化學和分子生物學中,這種凝膠電泳經常用來擴展DNA與RNA節(jié)段。接下來,Ozcan及其研究團隊計劃測試該領域的其他組件,進一步偵測與瘧疾有關的抗藥性。

延伸閱讀:蘋果開發(fā)應用收集用戶DNA數據

 

《麻省理工科技評論》報道稱,蘋果正在與美國多家研究機構合作開發(fā)應用,收集并整理用戶的基因數據。

 

報道援引消息人士的說法稱,這些應用將“向一些iPhone用戶提供機會,幫助他們進行基因檢測”。其中,許多人將是首次進行基因檢測。

這些新應用將基于蘋果的ResearchKit。這一數據整合平臺可以收集來自用戶設備的信息,將信息進行打包用于醫(yī)學研究。醫(yī)院和其他研究人員可以連接至ResearchKit平臺,從而迅速獲得大量的研究樣本。

 

蘋果目前已發(fā)布了一些基于ResearchKit的應用。在幾天之內,這些應用就吸引了數千用戶。

 

蘋果的下一步計劃是收集用戶的基因數據。不過,由于首先需要通過生物樣本去創(chuàng)建基因數據,因此蘋果將要求應用用戶提供唾液樣本。這些樣本不會被送往蘋果,而是被送往加州大學舊金山分?;蚣~約西奈山醫(yī)院的基因測序中心。研究人員將在ResearchKit的云計算平臺中保存這些數據,其中一些信息將直接出現在用戶的iPhone中。

 

在基因研究領域,蘋果和研究合作伙伴需要非常謹慎,避免獲取及展示基因信息的過程被視為一種“診斷”。2013年,基因科技公司23andMe由于這樣的問題遭到了美國食品藥品管理局的禁令。

 

蘋果尚未對此消息做出回應。

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